2008年3月6日，國家稅務(wù)總局下發(fā)了《關(guān)于印發(fā)〈企業(yè)所得稅核定征收辦法〉（試行）》（國稅發(fā)[2008]30號）（以下簡稱“新《核定征收辦法》”的通知，就新企業(yè)所得稅法施行后對企業(yè)所得稅核定征收作出了新的規(guī)定，此前，國家稅務(wù)總局曾在2000年下發(fā)過《核定征收企業(yè)所得稅暫行辦法》（國稅發(fā)[2000]38號）已失效對內(nèi)資企業(yè)企業(yè)所得稅核定征收進行了規(guī)范，同時在2007年8月下發(fā)《國家稅務(wù)總局關(guān)于調(diào)整核定征收企業(yè)所得稅應(yīng)稅所得率的通知》（國稅發(fā)[2007]104號）對核定征收的應(yīng)稅所得率進行了一次調(diào)整。

　　一、新《核定征收辦法》的五大變化
　　一是擴大了核定征收企業(yè)所得稅的范圍。為適應(yīng)新企業(yè)所得稅法施行的需要，核定征收范圍由原來的內(nèi)資企業(yè)擴大至所有的居民企業(yè)，而不僅僅只是適用原來的內(nèi)資企業(yè)

　　二是限定了核定征收的方法。將原來的核定征收辦法由定額征收、核定應(yīng)稅所得率和其他方法三種限定為核定應(yīng)稅所得率和核定應(yīng)納所得稅額兩種方法，取消了其他方法。

　　三是規(guī)定了核定征收企業(yè)要進行年度匯算清繳。原來規(guī)定僅要求對核定應(yīng)稅所得率的納稅人要求參加匯算清繳，新《核定征收辦法》要求對核定應(yīng)稅所得率和核定應(yīng)納所得稅額方式的納稅人在年規(guī)定的時限內(nèi)均需進行匯算清繳。

　　四是規(guī)定了核定征收企業(yè)可以享受優(yōu)惠政策，取消了原來征收辦法中“不得享受企業(yè)所得稅各項優(yōu)惠政策”的規(guī)定。

　　五是規(guī)定可隨時改為查帳征收。新《核定征收辦法》規(guī)定在一個納稅年度內(nèi)，對符合條件的，及時調(diào)整征收方式，實行查賬征收。

　　二、新核定征收辦法沒有解決的問題
　　1、未明確收入總額的界定。對實行按照應(yīng)稅所得稅率進行核定征收辦法的，要求納稅人在收入總額或成本費用支出額能夠正確核算的情況下，按照應(yīng)稅所得率計算應(yīng)納稅所得額，再計算出應(yīng)納稅額，據(jù)以申報納稅。對于能夠準確確定收入總額而無法確定成本費用的納稅人，按照應(yīng)稅所得率核定征收企業(yè)所得稅不失為一個相對比較科學(xué)和合理的辦法，但是，在實際執(zhí)行過程中，對于收入總額的認定卻是非常復(fù)雜。
一般認為收入總額應(yīng)當(dāng)包括以下幾個部份（1）生產(chǎn)、經(jīng)營收入；（2）財產(chǎn)轉(zhuǎn)讓收入；（3）利息收入；（4）租賃收入；（5）特許權(quán)使用費收入；（6）股息收入；（7）其他收入等等?！秶叶悇?wù)總局關(guān)于核定征收企業(yè)所得稅的納稅人取得財政補貼收入計征所得稅的批復(fù)》（國稅函[2005]541號）同時明確財政補貼收入也應(yīng)并入收入總額。不難理解，這種按照收入總額與應(yīng)稅所得率來計算企業(yè)所得稅應(yīng)納所得額的方法主要是考慮到納稅人在取得收入之后，會發(fā)生相應(yīng)的成本費用支出，扣除這部份成本費用后即為應(yīng)納稅所得額。但是，這種辦法對于一些特殊行業(yè)卻會導(dǎo)致明顯的不公平，如代理業(yè)、存在總分包的建筑業(yè)、旅游業(yè)等行業(yè)納稅人，其雖取得了“收入”，但是該“收入”中的其主要業(yè)務(wù)都是由其他單位進行，該業(yè)務(wù)的成本、費用主要發(fā)生在其他單位，其本單位取得的只是部份差額收入，因此，對于這些行業(yè)依據(jù)其所取得的所有"收入"來依照核定應(yīng)稅所得率計算繳納企業(yè)所得稅會導(dǎo)致納稅人稅負明顯偏重，無法體現(xiàn)取得所得繳納相應(yīng)所得稅的科學(xué)性。

　　2、核定征收辦法太少。新《核定征收辦法》僅規(guī)定了核定應(yīng)稅所得率和核定應(yīng)納所得稅額兩種辦法，對征管法實施細則規(guī)定的核定方法進行了限定，但是這種限定是欠缺考慮的，不能夠完全包含所有核定方法，應(yīng)該說這是新《核定征收方法》的一大敗筆。舉例說明：如果一個企業(yè)當(dāng)時沒有申報企業(yè)所得稅，也無法提供賬冊來準確判定收入或成本費用支出，那么事后稅務(wù)機關(guān)進行核定時，在新《核定征收辦法》里就找不到核定方法，因為如果是采用核定應(yīng)稅所得率的話，則沒有辦法確定收入或成本費用總額，如果采用核定應(yīng)納所得稅額的話，根據(jù)新《核定征收企業(yè)所得稅》第十四條的規(guī)定，由于核定應(yīng)納所得稅額是對企業(yè)當(dāng)年度的預(yù)先核定，對于這種事后核定也無法適用。

　　3、缺少對核定征收法律后果的規(guī)定。對于核定征收的法律責(zé)任主要體現(xiàn)的征管法及其實施細則的規(guī)定當(dāng)中，筆者這里所述的法律責(zé)任不僅限于其違法行為造成的違法責(zé)任，而是指納稅人因核定征收而導(dǎo)致多繳或少繳企業(yè)所得稅的相應(yīng)稅款繳納責(zé)任或退稅的權(quán)利。根據(jù)新《核定征收方法》的規(guī)定，對于核定征收企業(yè)所得稅的納稅人，原則上在年終匯算清繳時，實行實行多定不退，少定補征的方法，可以說是對于納稅人的一種未準確核算的相應(yīng)懲罰措施。但是，如果納稅人在不同年度或同一年度內(nèi)因采取不同征收方法而導(dǎo)致的相應(yīng)多繳稅款或少繳稅款的法律后果，卻沒有明確規(guī)定，從而會導(dǎo)致納稅人的異議，如在核定征收與查帳征收發(fā)生變化時能否進行彌補以前年度的虧損？如納稅人因查帳征收或核定征收而導(dǎo)致賬面利潤太多或太少時，稅務(wù)機關(guān)能否依利潤太高或太低而進行調(diào)整征收方法？由此產(chǎn)生的滯納金是否應(yīng)當(dāng)加收？這些規(guī)定的不明確，導(dǎo)致了納稅人應(yīng)納稅款預(yù)期的不確定性，與市場經(jīng)濟追求穩(wěn)定可預(yù)期的價值目標是相違背的。

補充規(guī)定：國稅函[2009]377號 企業(yè)所得稅核定征收若干問題