2009年2月26日，財政部、國家稅務(wù)總局發(fā)文《財政部、國家稅務(wù)總局關(guān)于公布若干廢止和失效的增值稅規(guī)范性文件目錄的通知》（財稅[2009]17號），這主要是根據(jù)修訂后的《中華人民共和國增值稅暫行條例》和《中華人民共和國增值稅暫行條例實施細則》進行的清理。此次全文廢止或失效文件14個，部分廢止或失效文件7個。

　　一、全文廢止或失效的文件（14件）
　　（一）《關(guān)于運輸費用和廢舊物資準(zhǔn)予抵扣進項稅額問題的通知》[（94）財稅字第012號]
　　1、作廢文件的主要內(nèi)容：（1）對增值稅一般納稅人外購貨物（固定資產(chǎn)除外）所支付的運輸費用，根據(jù)運費結(jié)算單據(jù)（普通**）所列運費金額依10%的扣除率計算進項稅額準(zhǔn)予扣除，但隨同運費支付的裝卸費、保險費等其他雜費不得計算扣除進項稅額。（2）從事廢舊物資經(jīng)營的增值稅一般納稅人收購的廢舊物資不能取得增值稅專用**的，根據(jù)經(jīng)主管稅務(wù)機關(guān)批準(zhǔn)使用的收購憑證上注明的收購金額，依10%的扣除率計算進項稅額予以扣除。（3）從1994年5月1日起執(zhí)行。

　　2、《財政部、國家稅務(wù)總局關(guān)于調(diào)整增值稅運輸費用扣除率的通知》（財稅字[1998]114號）規(guī)定：經(jīng)國務(wù)院批準(zhǔn)，從1998年7月1日起，將增值稅一般納稅人購進或銷售應(yīng)稅貨物支付的運輸費用的扣除率由10%降低為7%。凡1998年7月1日以后申報抵扣的運輸費用進項稅額，不論運輸**何時開具，其所注明的運輸費用是否已經(jīng)支付，均按7%的扣除率計算進項稅額。

　　3、取代者《關(guān)于再生資源增值稅政策的通知》（財稅[2008]157號文件）規(guī)定：自2009年1月1日起，取消"廢舊物資回收經(jīng)營單位銷售其收購的廢舊物資免征增值稅"和"生產(chǎn)企業(yè)增值稅一般納稅人購入廢舊物資回收經(jīng)營單位銷售的廢舊物資，可按廢舊物資回收經(jīng)營單位開具的由稅務(wù)機關(guān)監(jiān)制的普通**上注明的金額，按10%計算抵扣進項稅額"的政策。單位和個人銷售再生資源，應(yīng)當(dāng)依照《中華人民共和國增值稅暫行條例》（以下簡稱增值稅條例）、《中華人民共和國增值稅暫行條例實施細則》及財政部、國家稅務(wù)總局的相關(guān)規(guī)定繳納增值稅。但個人（不含個體工商戶）銷售自己使用過的廢舊物品免征增值稅。增值稅一般納稅人購進再生資源，應(yīng)當(dāng)憑取得的增值稅條例及其細則規(guī)定的扣稅憑證抵扣進項稅額，原印有“廢舊物資”字樣的專用**停止使用，不再作為增值稅扣稅憑證抵扣進項稅額。在2010年底以前，對符合條件的增值稅一般納稅人銷售再生資源繳納的增值稅實行先征后退政策。對符合退稅條件的納稅人2009年銷售再生資源實現(xiàn)的增值稅，按70%的比例退回給納稅人；對其2010年銷售再生資源實現(xiàn)的增值稅，按50%的比例退回給納稅人。

　　4、取代者《增值稅暫行條例》第8條規(guī)定，購進或者銷售貨物以及在生產(chǎn)經(jīng)營過程中支付運輸費用的，按照運輸費用結(jié)算單據(jù)上注明的運輸費用金額和7%的扣除率計算的進項稅額。進項稅額=運輸費用金額×扣除率?！对鲋刀悤盒袟l例實施細則》第18條規(guī)定，運輸費用金額，是指運輸費用結(jié)算單據(jù)上注明的運輸費用（包括鐵路臨管線及鐵路專線運輸費用）、建設(shè)基金，不包括裝卸費、保險費等其他雜費。

　　5、對企業(yè)的影響：（1）運費扣除率下降3%，直接影響企業(yè)的增值稅進項稅金抵扣，增加增值稅稅款的繳納。（2）廢舊物資經(jīng)營單位銷售廢舊物資扣除率10%變?yōu)?7%，對用廢企業(yè)來說，進項稅額的抵扣增加7%，是個大利好；而對廢舊物資經(jīng)營單位卻由免稅變?yōu)閼?yīng)稅，稅率為17%，雖然有增值稅先征后返的新規(guī)定，畢竟是按70%、50%返還，增值稅稅負大為增加。

　　（二）《關(guān)于城鎮(zhèn)公用事業(yè)附加應(yīng)納入增值稅計稅銷售額征收增值稅的通知》[財稅字（1994）第035號]規(guī)定：對在價外與應(yīng)征增值稅的銷售收入一并收取的城鎮(zhèn)公共事業(yè)附加，亦應(yīng)按照稅法規(guī)定納入增值稅計稅銷售額征收增值稅。

　　取代者《中華人民共和國增值稅暫行條例實施細則》（中華人民共和國財政部國家稅務(wù)總局令第50號）第十二條規(guī)定，條例第六條靠前款所稱價外費用，包括價外向購買方收取的手續(xù)費、補貼、基金、集資費、返還利潤、獎勵費、違約金、滯納金、延期付款利息、賠償金、代收款項、代墊款項、包裝費、包裝物租金、儲備費、優(yōu)質(zhì)費、運輸裝卸費以及其他各種性質(zhì)的價外收費。但下列項目不包括在內(nèi)，同時符合以下條件代為收取的***性基金或者行政事業(yè)性收費：1.由國務(wù)院或者財政部批準(zhǔn)設(shè)立的***性基金，由國務(wù)院或者省級人民***及其財政、價格主管部門批準(zhǔn)設(shè)立的行政事業(yè)性收費；2.收取時開具省級以上財政部門印制的財政票據(jù)；3.所收款項全額上繳財政。城鎮(zhèn)公用事業(yè)附加屬于此類。

　　對企業(yè)影響：相關(guān)企業(yè)的城鎮(zhèn)公用事業(yè)附加不再征收增值稅，將大大減輕企業(yè)的增值稅稅收負擔(dān)，促進企業(yè)資金流轉(zhuǎn)、擴大再生產(chǎn)以及更好更快的發(fā)展

　?。ㄈ蛾P(guān)于對煤炭調(diào)整稅率后征稅及退還問題的通知》[（94）財稅字第036號].（1）1994年4月27日，財政部、國家稅務(wù)總局以（94）財稅字第022號文件印發(fā)了《關(guān)于調(diào)整金屬礦、非金屬礦采選產(chǎn)品增值稅稅率的通知》規(guī)定，從1994年5月1日起，煤炭產(chǎn)品的增值稅稅率由17%調(diào)整為13%.

　　（2）取代者《財政部、國家稅務(wù)總局關(guān)于金屬礦非金屬礦采選產(chǎn)品增值稅稅率的通知》（財稅[2008]171號）規(guī)定，自2009年1月1日起，金屬礦采選產(chǎn)品、非金屬礦采選產(chǎn)品增值稅稅率由13%恢復(fù)到17%.本通知所稱金屬礦采選產(chǎn)品，包括黑色和有色金屬礦采選產(chǎn)品；非金屬礦采選產(chǎn)品，包括除金屬礦采選產(chǎn)品以外的非金屬礦采選產(chǎn)品、煤炭和鹽。

　　3、企業(yè)的影響。這是與全國范圍實施增值稅轉(zhuǎn)型改革相配套推出的政策。顯然會增加相關(guān)企業(yè)的增值稅稅負4%，由于相關(guān)企業(yè)外購設(shè)備納入進項稅額的抵扣范圍，整體稅負將有所下降，為公平稅負，規(guī)范稅制，促進資源節(jié)約和綜合利用，需要將金屬礦、非金屬礦采選產(chǎn)品的增值稅稅率恢復(fù)到17%.

　　（四）《關(guān)于加強商業(yè)環(huán)節(jié)增值稅征收管理的通知》（財稅字[1998]4號）
　　1、作廢文件內(nèi)容：因財務(wù)核算是否健全在實際操作中很難衡量和把握，大量的小型商業(yè)企業(yè)以財務(wù)核算健全為標(biāo)準(zhǔn)被認定為一般納稅人，增加了稅收管理的難度。鑒于商業(yè)環(huán)節(jié)異常納稅申報絕大部分發(fā)生在小型商業(yè)企業(yè)的一般納稅人中，為便于征收管理，減少收入流失，主管稅務(wù)機關(guān)應(yīng)嚴格對一般納稅人的審查，對銷售額達不到規(guī)定標(biāo)準(zhǔn)的小型商業(yè)企業(yè)原則上不要以財務(wù)核算健全為由認定為一般納稅人，而應(yīng)按小規(guī)模納稅人征稅。

　　2、取代者《中華人民共和國增值稅暫行條例實施細則》（中華人民共和國財政部國家稅務(wù)總局令第50號）第二十八條，暫行條例第十一條所稱小規(guī)模納稅人的標(biāo)準(zhǔn)為：（一）從事貨物生產(chǎn)或者提供應(yīng)稅勞務(wù)的納稅人，以及以從事貨物生產(chǎn)或者提供應(yīng)稅勞務(wù)為主，并兼營貨物批發(fā)或者零售的納稅人，年應(yīng)征增值稅銷售額（以下簡稱應(yīng)稅銷售額）在50萬元以下（含本數(shù)，下同）的；（二）除本條靠前款第（一）項規(guī)定以外的納稅人，年應(yīng)稅銷售額在80萬元以下的。本條靠前款所稱以從事貨物生產(chǎn)或者提供應(yīng)稅勞務(wù)為主，是指納稅人的年貨物生產(chǎn)或者提供應(yīng)稅勞務(wù)的銷售額占年應(yīng)稅銷售額的比重在50%以上。第二十九條，應(yīng)稅銷售額超過小規(guī)模納稅人標(biāo)準(zhǔn)的其他個人按小規(guī)模納稅人納稅；非企業(yè)性單位、不經(jīng)常發(fā)生應(yīng)稅行為的企業(yè)可選擇按小規(guī)模納稅人納稅。